L’Archivio conserva circa 15.000 unità archivistiche appartenenti ad un arco di tempo che va dalla seconda metà del XVI secolo, alla prima metà del XXI.
Dell’Archivio sono stati digitalizzati e schedati 21 documenti cartografici appartenenti alla platea del Capitolo Sipontino relativi all’amministrazione di San Pietro in Cuppis, di Ischitella, nel Gargano, una delle più antiche abbazie di Puglia.